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@@ -0,0 +1,4 @@
// juste un type énuméré pour nommer les bases
public enum Base {
A,C,G,T
}

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@@ -0,0 +1,34 @@
// Fichier Exemple pour le second exercice sur l'ADN
public class Exemple{
public static void main(String[] args) {
// codon GCT code l'analine https://en.wikipedia.org/wiki/DNA_codon_table
// stop codon TAG, voir https://en.wikipedia.org/wiki/Stop_codon
System.out.println("construction du brin GCTTAG");
MonMaillon l = new MonMaillon(Base.G);
l = new MonMaillon(Base.A,l);
l = new MonMaillon(Base.T,l);
l = new MonMaillon(Base.T,l);
l = new MonMaillon(Base.C,l);
l = new MonMaillon(Base.G,l);
MonBrin b = new MonBrin(l);
System.out.println("l'affichage par défaut du brin ne va pas vous plaire");
System.out.println(b.toString());
System.out.println("On peut maintenant afficher en itérant avec un while comme ceci");
while (b.hasNext()){
System.out.println(b.next());
}
// ajouter du code ici pour gérer les questions en plus
// (simulation de plusieurs navigations successives)
// (simulation de plusieurs navigations simultanées)
}
}

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@@ -0,0 +1,45 @@
import java.util.Iterator;
import java.util.NoSuchElementException;
/**
MonBrin code un brin d'ADN sous forme de liste simplement chaînée.
Plusieurs instances de MonMaillon reliées convenablement forment une structure de liste simplement chaînée contenant pour chaque maillon le nom de la base.
On n'utilise pas java.util et on recode tout.
Cette version a un problème : la structuration et la navigation sont dans la même classe.
*/
public class MonBrin implements Iterator<Base> {
private MonMaillon premier;
private MonMaillon courant;
public MonBrin(MonMaillon premier){
this.premier = premier;
this.courant = premier;
}
public MonMaillon getDebut(){
return this.premier;
}
// rappel : on met @Override pour dire au compilateur qu'on veut surcharger (en particulier c'est le cas quand on implémente une interface)
// ce n'est pas nécessaire dans ce cas mais ça permet d'avoir des messages d'alerte si on se trompe (typo dans le nom de la méthode ...)
// voir https://stackoverflow.com/questions/94361/when-do-you-use-javas-override-annotation-and-why
@Override
public boolean hasNext(){
return this.courant != null;
}
@Override
public Base next() {
Base base = this.courant.getBase();
this.courant = this.courant.getSuiteMaillon();
return base;
}
}

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@@ -0,0 +1,36 @@
import java.util.Iterator;
/**
MonMaillon code un maillon d'un brin d'ADN.
plusieurs instances reliées convenablement forment une structure de liste simplement chaînée contenant pour chaque maillon le nom de la base.
On n'utilise pas java.util et on recode tout.
*/
public class MonMaillon implements Iterable {
private Base b;
private MonMaillon l;
public MonMaillon(Base b) {
this.b = b;
}
public MonMaillon(Base b, MonMaillon l){
this.b = b;
this.l = l;
}
public Base getBase(){
return this.b;
}
public MonMaillon getSuiteMaillon(){
return l;
}
@Override
public Iterator iterator() {
return new MonBrin(l);
}
}