tout marche sauf le dernier
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// juste un type énuméré pour nommer les bases
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public enum Base {
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A,C,G,T
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}
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@@ -0,0 +1,31 @@
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// Fichier Exemple pour le premier exercice sur l'ADN
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public class Exemple{
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public static void main(String[] args) {
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// codon GCT code l'analine https://en.wikipedia.org/wiki/DNA_codon_table
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// stop codon TAG, voir https://en.wikipedia.org/wiki/Stop_codon
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System.out.println("construction du brin GCTTAG");
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MonMaillon l = new MonMaillon(Base.G);
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l = new MonMaillon(Base.A,l);
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l = new MonMaillon(Base.T,l);
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l = new MonMaillon(Base.T,l);
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l = new MonMaillon(Base.C,l);
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l = new MonMaillon(Base.G,l);
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MonBrin b = new MonBrin(l);
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System.out.println("l'affichage par défaut du brin ne va pas vous plaire");
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System.out.println(b.toString());
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System.out.println("On peut afficher en avançant");
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System.out.println("Il faut s'en inspirer pour implémenter l'interface iterator de Java.util");
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MonMaillon actuel = b.getDebut();//NB: c'est comme l ci-dessus
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while (actuel != null){
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System.out.println(actuel.getBase());
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actuel = actuel.getSuiteMaillon();
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}
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}
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}
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Binary file not shown.
@@ -0,0 +1,68 @@
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/**
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MonBrin code un brin d'ADN sous forme de liste simplement chaînée.
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Plusieurs instances de MonMaillon reliées convenablement forment une structure de liste simplement chaînée contenant pour chaque maillon le nom de la base.
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On n'utilise pas java.util et on recode tout.
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Cette version a un problème : la navigation n'est pas raisonnable
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*/
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public class MonBrin {
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private MonMaillon debut;
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private MonMaillon courant;
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public MonBrin(MonMaillon p) {
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this.debut = p;
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this.courant = p; // Initialiser courant pour le parcours
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}
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public MonMaillon getDebut() {
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return this.debut;
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}
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// Méthode hasNext pour vérifier s'il y a un élément suivant
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public boolean hasNext() {
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return courant != null;
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}
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// Méthode next pour obtenir la base actuelle et avancer
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public Base next() {
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if (!hasNext()) {
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throw new RuntimeException("No more elements in the brin.");
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}
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Base baseActuelle = courant.getBase();
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courant = courant.getSuiteMaillon(); // Avancer au maillon suivant
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return baseActuelle;
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}
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@Override
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public String toString() {
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StringBuilder sb = new StringBuilder();
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MonMaillon temp = this.debut;
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while (temp != null) {
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sb.append(temp.getBase()).append(" ");
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temp = temp.getSuiteMaillon();
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}
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return sb.toString().trim();
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}
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}
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/*
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public class MonBrin {
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//Le constructeur fabrique un brin à partir du premier maillon p;
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public MonBrin(MonMaillon p){
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throw new UnsupportedOperationException("cette méthode n'est pas implémentée");
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}
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public MonMaillon getDebut(){
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throw new UnsupportedOperationException("cette méthode n'est pas implémentée");
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}
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et pour naviguer?
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On pourrait implémenter l'interface iterator de java.util ici
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}
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*/
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Binary file not shown.
@@ -0,0 +1,57 @@
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/**
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MonMaillon code un maillon d'un brin d'ADN.
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||||
plusieurs instances reliées convenablement forment une structure de liste simplement chaînée contenant pour chaque maillon le nom de la base.
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||||
On n'utilise pas java.util et on recode tout.
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*/
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public class MonMaillon {
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private Base base;
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private MonMaillon suivant;
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// Constructeur pour un seul maillon avec une base
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public MonMaillon(Base b) {
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this.base = b;
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this.suivant = null;
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}
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||||
// Constructeur pour ajouter un maillon à une chaîne existante
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public MonMaillon(Base b, MonMaillon l) {
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this.base = b;
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this.suivant = l;
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}
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public Base getBase() {
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return this.base;
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}
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public MonMaillon getSuiteMaillon() {
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return this.suivant;
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}
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}
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||||
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/*
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public class MonMaillon {
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//Le constructeur de base retourne un brin à une base;
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public MonMaillon(Base b){
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throw new UnsupportedOperationException("cette méthode n'est pas implémentée");
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}
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||||
// Le constructeur évolué ajoute une base à un brin.
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public MonMaillon(Base b, MonMaillon l){
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||||
throw new UnsupportedOperationException("cette méthode n'est pas implémentée");
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}
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||||
public Base getBase(){
|
||||
throw new UnsupportedOperationException("cette méthode n'est pas implémentée");
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||||
}
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||||
public MonMaillon getSuiteMaillon(){
|
||||
throw new UnsupportedOperationException("cette méthode n'est pas implémentée");
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||||
}
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||||
}
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||||
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*/
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