15 Decembre

DEV3.4/TP4/stub/1Iterable/Base.java

@@ -0,0 +1,4 @@
+// juste un type énuméré pour nommer les bases
+public enum Base {
+    A,C,G,T
+}

DEV3.4/TP4/stub/1Iterable/Exemple.java

@@ -0,0 +1,34 @@
+// Fichier Exemple pour le second exercice sur l'ADN
+
+public class Exemple{
+    public static void main(String[] args) {
+        // codon GCT code l'analine https://en.wikipedia.org/wiki/DNA_codon_table
+        // stop codon TAG, voir https://en.wikipedia.org/wiki/Stop_codon
+
+        System.out.println("construction du brin GCTTAG");
+        MonMaillon l = new MonMaillon(Base.G);
+        l = new MonMaillon(Base.A,l);
+        l = new MonMaillon(Base.T,l);
+        l = new MonMaillon(Base.T,l);
+        l = new MonMaillon(Base.C,l);
+        l = new MonMaillon(Base.G,l);
+
+        MonBrin b = new MonBrin(l);
+        
+        System.out.println("l'affichage par défaut du brin ne va pas vous plaire");
+        System.out.println(b.toString());
+        
+        System.out.println("On peut maintenant afficher en itérant avec un while comme ceci");
+
+        while (b.hasNext()){
+            System.out.println(b.next());
+        }
+
+        // ajouter du code ici pour gérer les questions en plus
+        // (simulation de plusieurs navigations successives)
+
+
+        // (simulation de plusieurs navigations simultanées)
+    }
+
+}

DEV3.4/TP4/stub/1Iterable/MonBrin.java

@@ -0,0 +1,59 @@
+import java.util.Iterator;
+import java.util.NoSuchElementException;
+/** 
+    MonBrin code un brin d'ADN sous forme de liste simplement chaînée.
+
+    Plusieurs instances de MonMaillon reliées convenablement forment une structure de liste simplement chaînée contenant pour chaque maillon le nom de la base.
+
+    On n'utilise pas java.util et on recode tout.
+
+    Cette version a un problème : la navigation n'est pas raisonnable
+*/
+public class MonBrin implements Iterator<Base>{
+
+    public MonMaillon debut;
+    public MonMaillon index;
+    //Le constructeur fabrique un brin à partir du premier maillon p;
+    public MonBrin(MonMaillon p){
+        this.debut = p;
+        this.index = p;
+    }
+
+    public MonMaillon getDebut(){
+        return this.debut;
+    }
+
+    public MonMaillon getIndex(){
+        return this.index;
+    }    
+
+    // rappel : on met @Override pour dire au compilateur qu'on veut surcharger (en particulier c'est le cas quand on implémente une interface)
+    // ce n'est pas nécessaire dans ce cas mais ça permet d'avoir des messages d'alerte si on se trompe (typo dans le nom de la méthode ...)
+    // voir https://stackoverflow.com/questions/94361/when-do-you-use-javas-override-annotation-and-why
+    @Override
+    public boolean hasNext(){
+        if (this.index.suivant==null){
+            return false;
+        }
+        else{
+            return true;
+        }
+    }
+
+    @Override
+    public Base next() {
+        if (this.hasNext()){
+            this.index = this.index.suivant;
+            return this.index.b;
+        }
+        else{
+            throw new NoSuchElementException();
+        }
+
+    }
+
+}
+
+
+
+

DEV3.4/TP4/stub/1Iterable/MonMaillon.java

@@ -0,0 +1,33 @@
+/** 
+    MonMaillon code un maillon d'un brin d'ADN.
+    plusieurs instances reliées convenablement forment une structure de liste simplement chaînée contenant pour chaque maillon le nom de la base.
+    On n'utilise pas java.util et on recode tout.
+
+*/
+public class MonMaillon {
+
+    public Base b;
+    public MonMaillon suivant;
+    //Le constructeur de base retourne un brin à une base;
+    public MonMaillon(Base b){
+        this.b = b;
+        this.suivant = null;
+    }
+
+    // Le constructeur évolué ajoute une base à un brin.
+    public MonMaillon(Base b, MonMaillon l){
+        this.b = b;
+        this.suivant = l;
+    }
+
+    public Base getBase(){
+        return this.b;
+    }
+
+    public MonMaillon getSuiteMaillon(){
+        return this.suivant;
+    }
+    
+}
+
+