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TP4/stub/1Iterable/Base.java

@@ -0,0 +1,4 @@
+// juste un type énuméré pour nommer les bases
+public enum Base {
+    A,C,G,T
+}

TP4/stub/1Iterable/Exemple.java

@@ -0,0 +1,35 @@
+// Fichier Exemple pour le second exercice sur l'ADN
+
+public class Exemple{
+    public static void main(String[] args) {
+        // codon GCT code l'analine https://en.wikipedia.org/wiki/DNA_codon_table
+        // stop codon TAG, voir https://en.wikipedia.org/wiki/Stop_codon
+
+        System.out.println("construction du brin GCTTAG");
+        MonMaillon l = new MonMaillon(Base.G);
+        l = new MonMaillon(Base.A,l);
+        l = new MonMaillon(Base.T,l);
+        l = new MonMaillon(Base.T,l);
+        l = new MonMaillon(Base.C,l);
+        l = new MonMaillon(Base.G,l);
+
+        MonBrin b = new MonBrin(l);
+        
+        System.out.println("l'affichage par défaut du brin ne va pas vous plaire");
+        System.out.println(b.toString());
+        
+        System.out.println("On peut maintenant afficher en itérant avec un while comme ceci");
+
+        while (b.hasNext()){
+            System.out.println(b.next());
+        }
+
+        // ajouter du code ici pour gérer les questions en plus
+        // (simulation de plusieurs navigations successives)
+        
+
+
+        // (simulation de plusieurs navigations simultanées)
+    }
+
+}

TP4/stub/1Iterable/MonBrin.java

@@ -0,0 +1,55 @@
+import java.util.Iterator;
+import java.util.NoSuchElementException;
+
+/** 
+    MonBrin code un brin d'ADN sous forme de liste simplement chaînée.
+
+    Plusieurs instances de MonMaillon reliées convenablement forment une structure
+    simplement chaînée contenant pour chaque maillon le nom de la base.
+
+    On n'utilise pas java.util (pas de ArrayList, etc.) et on recode tout.
+
+    Dans cet exercice, cette classe implémente aussi Iterator<Base> :
+    elle sait donc se parcourir elle-même.
+*/
+public class MonBrin implements Iterator<Base> {
+
+    // Premier maillon du brin
+    private MonMaillon debut;
+
+    // Maillon courant pour la navigation (iterator)
+    private MonMaillon courant;
+
+    // Le constructeur fabrique un brin à partir du premier maillon p;
+    public MonBrin(MonMaillon p){
+        this.debut = p;
+        this.courant = p; // l'itération commence au début du brin
+    }
+
+    public MonMaillon getDebut(){
+        return this.debut;
+    }
+    
+    /** Méthodes de l'interface Iterator<Base> */
+
+    @Override
+    public boolean hasNext() {
+        return this.courant != null;
+    }
+
+    @Override
+    public Base next() {
+        if (this.courant == null) {
+            throw new NoSuchElementException("Plus de base dans ce brin");
+        }
+        Base valeur = this.courant.getBase();
+        this.courant = this.courant.getSuiteMaillon();
+        return valeur;
+    }
+
+    @Override
+    public void remove() {
+        // On ne gère pas la suppression dans ce TP
+        throw new UnsupportedOperationException("remove() n'est pas supporté");
+    }
+}

TP4/stub/1Iterable/MonMaillon.java

@@ -0,0 +1,36 @@
+/** 
+    MonMaillon code un maillon d'un brin d'ADN.
+    Plusieurs instances reliées convenablement forment une structure
+    simplement chaînée contenant pour chaque maillon le nom de la base.
+    On n'utilise pas java.util et on recode tout.
+*/
+public class MonMaillon {
+
+    // La base stockée dans ce maillon
+    private Base base;
+
+    // Le maillon suivant dans la chaîne (null si fin du brin)
+    private MonMaillon suite;
+
+    // Le constructeur de base retourne un brin à une base;
+    public MonMaillon(Base b){
+        this.base = b;
+        this.suite = null;
+    }
+
+    // Le constructeur évolué ajoute une base à un brin.
+    public MonMaillon(Base b, MonMaillon l){
+        this.base = b;
+        this.suite = l;
+    }
+
+    public Base getBase(){
+        return this.base;
+    }
+
+    public MonMaillon getSuiteMaillon(){
+        return this.suite;
+    }
+}
+
+