// Fichier Exemple pour le second exercice sur l'ADN

public class Exemple {
    public static void main(String[] args) {
        // codon GCT code l'analine https://en.wikipedia.org/wiki/DNA_codon_table
        // stop codon TAG, voir https://en.wikipedia.org/wiki/Stop_codon

        System.out.println("construction du brin GCTTAG");
        MonMaillon l = new MonMaillon(Base.G);
        l = new MonMaillon(Base.A, l);
        l = new MonMaillon(Base.T, l);
        l = new MonMaillon(Base.T, l);
        l = new MonMaillon(Base.C, l);
        l = new MonMaillon(Base.G, l);

        MonBrin b = new MonBrin(l);

        System.out.println("l'affichage par défaut du brin ne va pas vous plaire");
        System.out.println(b.toString());

        System.out.println("On peut maintenant afficher en itérant avec un while comme ceci");

        while (b.hasNext()) {
            System.out.println(b.next());
        }

        // Simulation de plusieurs navigations successives
        System.out.println("Navigation successive avec l'index secondaire :");
        while (b.hasNextSecondaire()) {
            System.out.println(b.nextSecondaire());
        }

        System.out.println("Navigation successive avec l'index tertiaire :");
        while (b.hasNextTertiaire()) {
            System.out.println(b.nextTertiaire());
        }

        // Simulation de plusieurs navigations simultanées
        System.out.println("Navigation simultanée :");
        if (b.hasNextSecondaire())
            System.out.println("Secondaire: " + b.nextSecondaire());
        if (b.hasNextTertiaire())
            System.out.println("Tertiaire: " + b.nextTertiaire());
        if (b.hasNextSecondaire())
            System.out.println("Secondaire: " + b.nextSecondaire());
    }
}